Il 15 maggio 1986, con Decreto del Presidente della Repubblica n. 283, l’Istituto è stato riconosciuto come Fondazione ed eretto in ente morale.

L'articolo 2 dello Statuto indica le finalità della Fondazione: "La Fondazione si pone il compito di promuovere, finanziare e condurre, per conto proprio o in associazione con altri, attività di ricerca, editoriali e di formazione, e ogni altra attività culturale diretta all'approfondimento e alla divulgazione della conoscenza della società italiana contemporanea, con particolare riferimento ai fenomeni politici, sociali, culturali ed economici, alla vita e al funzionamento delle istituzioni e ai vari aspetti dell'organizzazione sociale basata su un sistema di libertà collettive e individuali costituzionalmente garantite. Preoccupazione primaria della Fondazione è l'attenzione ai dati documentari, e sua regola qualificante la natura non riservata dei risultati degli studi e delle ricerche, nella convinzione che la conoscenza dei succitati fenomeni sia un fattore di sviluppo democratico e di vigore per la vita civile".

Lo statuto della Fondazione prevede che l’Associazione "il Mulino" designi due soci che, assieme ad altri due membri designati in altro modo, formano il Consiglio direttivo della Fondazione.

Il Consiglio direttivo della Fondazione è attualmente composto da: Asher Daniel Colombo, Piergiorgio Corbetta, Elisabetta Gualmini, Francesco Vella.